为实现城市发展的总目标和各分目标，总规草案对城市发展提出四大政策指引，包括区域协作、经济转型、社会和谐及生态保护。
1、强化区域协作
规划提出，要加强深圳与珠三角及内地城市的联系，加强深港合作，全面提高深圳的国际化水平。规划提出建立与内地更为广泛和深入的联系，加强与珠三角地区其它城市的多边合作和规划衔接，制定发展区域产业集群和激励区域体制创新政策，加快形成上下游功能互补的区域产业链。建立区域统一的劳动力市场、资金要素市场和土地市场。合作开展区域生态建设与环境保护。共同推进重要生态功能地区特别是自然保护区、风景名胜区的保护。加强区域水环境功能区划协调，共同编制流域水环境保护规划。
规划强调完善深港金融合作机制，建立共同的资本市场，积极探索深圳金融机构通过香港进入国际金融市场，继续吸引香港金融机构在深圳设立分支机构，进入内地金融市场。积极建设深港创新圈，加强两地生产企业、科研机构及高校间的合作，鼓励双方人员在创新领域的交流。加强双方在生产研发、创新和知识产权管理、保护和使用等方面的交流与合作。加强与香港在高新技术产业和高端服务业的合作。依托深圳对内地的联系优势和香港对境外的联系优势，坚持不懈地走向国际市场，不断提升深圳的国际影响力。加强跨界交通方面的衔接和合作，促进深港交通一体化建设，缩短通关时间，为资金、人才和信息等要素的流动提供更大的便捷。
2、推动经济转型
规划提出，未来我市将继续强化支柱产业，大力发展高新技术产业、现代金融业、现代物流业和特色文化产业，形成多元化的产业结构。同时，大力推进传统产业升级，制定基于全球产业价值链的产业升级政策，扶持传统产业高新化，不断提高产品的技术含量和企业的创新能力。
按照规划，我市将大力发展循环经济和绿色产业，提高研发投入占GDP的比重，加快发展创新能力强、拥有自主知识产权的高新技术龙头企业。建立包括节能减排等内容的“绿色GDP”指标核算体系，将其作为主要宏观调控指标。有效运用价格、税收、许可证等多种经济手段，推广万元GDP水耗和能耗的政府考核机制。
3、实现社会和谐
规划针对“社会和谐”提出加强城市公共安全，促进城市人口的适度稳定，保障基本居住条件，优先发展公共交通，保障社会民生等政策。
在保障基本居住条件方面，提出建立以低收入家庭为主要服务对象，并与人口政策相适应的住房保障体系。加强房地产市场的宏观调控，合理调整商品住房供给结构，减缓居住成本过快增长。发展面向低收入家庭的廉租住房和经济适用房，加快解决城市低收入家庭的住房困难，多渠道改善外来工居住条件。挖掘城中村住房存量的潜在供应能力，通过政府收回或回购等政策手段，将部分城中村住房纳入住房保障体系。规划期内新增住房建筑面积1.2~1.5亿平方米，住房建筑面积总规模达到3.7~4.0亿平方米。通过新建和回购存量社会住房等方式，增加供应3000万平方米政策保障性住房。
总规提出，深圳要实行按居住地进行管理服务人口登记的制度，建立社区管理服务中心，在职业培训、子女教育、医疗养老等方面为管理服务人口提供服务。
完善与人口结构特征相适应的社会保障机制，提高暂住人口的社会保险综合参保率和外来务工人员的参保率，推进社会和谐。
4、加强生态保护
规划提出了保护生态绿地资源，合理利用海洋岸线资源，高效利用能源和水资源，节约集约利用土地资源，建设并保护优良的生态环境等政策指引。
提出要依据城市基本生态控制线，保证城市的生态空间，对已遭受破坏的环境进行生态恢复。重点建设森林公园、郊野公园、城市公园以及居住区公园，拓展城市绿化空间，特区内新建城市公园32个，特区外新建城市公园108个。到规划期末，人均公共绿地达到6平方米，城市建成区绿地率40％。
保护野生生物栖息环境，保护乡土植物，维护生物多样性。合理利用海洋岸线，制定具有差异性的海岸资源管理政策，保证海洋资源在各海洋行业内合理配置，使海洋空间和海岸资源得到充分利用。
高效利用能源、水资源和再生资源。改善能源结构，大力发展清洁能源，严格高消耗、高污染行业的准入标准。加快推出鼓励生产、使用节能产品的财税政策。加强节能减排，建立“绿色GDP”的政绩评估机制。促进清洁能源、可再生能源和新能源的开发利用。制定鼓励对节能、节水、节材产品和废旧物资回收利用政策。加强交通节能，治理交通污染。
加强水污染综合整治，修复水生态系统。按照国际化标准综合处理及利用固体废弃物及生活垃圾。提高产业环境准入标准。防治大气污染，改善城市声环境。
